Синтез длинных пептидов|Индивидуализация длинноцепочечных пептидов|Синтез сложных пептидов|Пептиды более 50членов|Наука-Пептид
Мета-описание
Нужен длинный пептид, содержащий более 50 аминокислот? Наука-Услуга Peptide по синтезу длинных пептидов охватывает 50–189 аминокислот, используя стратегию сегментированного синтеза, позволяющую преодолевать проблемы гидрофобной агрегации и низкой эффективности синтеза и т. д.. 20 Многолетний опыт и стабильная доставка. Добро пожаловать, свяжитесь с нами.
Длинные пептиды: чем они длиннее, тем больше проблем они причиняют.
Почему длинные пептиды трудно получить?
Любой, кто занимался синтезом пептидов, знает, что проблема возникает, когда пептидная цепь длинная: в пределах 20 аминокислот большинство компаний могут это сделать. Когда дело доходит до более чем 40 аминокислот, мы начинаем подбирать последовательность. При наличии 60 аминокислот и более количество компаний, которые могут взять на себя управление, сокращается вдвое. Когда дело доходит до более чем 100 аминокислот, немногие компании осмеливаются это сделать.
Почему? Потому что синтез длинных пептидов сталкивается с несколькими подводными камнями:
Эффективность синтеза снижается: при каждом расширении аминокислоты выход будет дисконтироваться один раз. 30 аминокислотного пептида, каждый шаг с выходом 99%, конечный выход по-прежнему составляет 74%; 60 аминокислот, каждый шаг по-прежнему 99%, конечный выход всего 55%. На самом деле выход многих ступеней не может достигать 99%.
Гидрофобная агрегация. Когда в длинном пептиде много гидрофобных аминокислот, пептидная цепь начинает «слипаться» на смоле, и аминокислоты, находящиеся за ней, не могут проникнуть в нее.
Сложность очистки: время удерживания длинных пептидов и примесей слишком близко друг к другу для чистого разреза.
Плохая растворимость: когда пептид получен, его нельзя растворить, поэтому эксперимент нельзя проводить.
Мы уже бывали в таких выбоинах и знаем, как их обойти.

Что мы можем сделать
1. Длина: 50-189 аминокислот.
|
диапазон длин |
Сложность |
Мы сталкивались с ситуациями, когда |
|
50-80 а.а. |
Высший средний класс |
Routine program with >90% вероятность успеха |
|
80-120 а.к. |
Высокий |
Нужна стратегия сегментированного синтеза, достаточный опыт |
|
120-150 а.к. |
Очень высокий |
Я их сделал много, до 150. |
|
150-189 а.а. |
Чрезвычайно высокий |
Уровень сложности, с историями успеха |
2. Стратегия сегментированного синтеза
Самый эффективный способ борьбы с длинными пептидами — сегментировать их:
Выбор сегмента: разрежьте длинный пептид на 2–4 сегмента по 30–60 аминокислот каждый. Точка разреза должна быть расположена в положении, где сложность синтеза невелика, например, избегая непрерывной гидрофобной области.
Синтез фрагментов: каждый фрагмент синтезируется и очищается индивидуально до достаточно высокой чистоты.
Сращивание фрагментов: соединение фрагментов в растворе или на смоле. Способ соединения может быть как природным химическим, так и ферментативным.
Складывание: если пептид имеет дисульфидную связь, после сплайсинга он должен быть сложен в правильную конформацию.
3. Чистота: в зависимости от экспериментальных требований.
|
Уровень чистоты |
Применимые сценарии |
|
Обычный чистый (85-95%) |
Сочетание экспериментального и активного первичного скрининга |
|
Высокая чистота (95-98%) |
клеточные эксперименты, функциональная проверка |
|
Ultrapure (>98%) |
Структурные исследования, кристаллография |
Каждый длинный пептид сопровождается отчетом ВЭЖХ и МС, что делает данные о чистоте прозрачными.
4. Модификации: длинные пептиды также могут добавлять функции.
Флуоресцентная маркировка: FITC, TAMRA, хотят увидеть, куда проходит длинный пептид.
Биотин: выполните-опускание или проверьте.
Мечение изотопов: для количественного определения ЯМР или масс-спектрометрии.
Фосфорилирование/гликозилирование: имитация пост-трансляционных модификаций.
Почему стоит прийти к нам на синтез длинных пептидов?
1. Мы занимаемся этим уже 20 лет
Синтез длинных пептидов – это не то, что может сделать каждый. За прошедшие годы мы имели дело со многими длинными пептидами: фрагментами трансмембранных белков, слитыми вирусными пептидами, амилоидными белками, антимикробными пептидами и т. д. У нас есть хорошее представление о том, какие последовательности легко агрегируются и какие условия могут их сохранить. Если вы придете к нам на синтез длинных пептидов, вам, по крайней мере, не придется с самого начала наступать на яму.
2. Фракционный синтез: не просто резать на части
Сегментация звучит просто, но важно, где разрезать, какой длины каждый сегмент и как их соединить. У нас есть несколько принципов:
Разрезайте гидрофильную зону: избегайте разрезания гидрофобной сердцевины, иначе сегменты соберутся сами по себе.
Сбалансируйте длину фрагментов: не делайте один сегмент особенно трудным, а другие — особенно простыми.. 3.
Выбор точки соединения. Природные химические соединения требуют наличия тиоэфира на C-конце и Cys на N-конце, который необходимо спроектировать заранее.
3. Гидрофобные пептиды: специальная система растворителей.
Некоторые длинные пептиды настолько гидрофобны, что их нельзя растворить обычными растворителями, поэтому при синтезе они слипаются на смоле. У нас есть специальная система растворителей и добавки, которые поддерживают растяжение пептидной цепи во время процесса синтеза, чтобы могли проникнуть следующие аминокислоты.
4. Контроль качества: данные на каждом этапе
Контроль качества длинных пептидов более сложен, чем у коротких:
Контроль качества полупродуктов: после синтеза каждого фрагмента сначала измеряют чистоту и молекулярную массу, а затем после прохождения теста переходят к следующему этапу.
Мониторинг процесса сварки: попробуйте реакцию соединения и измерьте MS, чтобы увидеть эффективность соединения.
Проверка конечного продукта: ВЭЖХ на чистоту, МС на молекулярную массу, МС/МС на правильность последовательности (опционально).
Тест на растворимость: предоставьте рекомендуемые растворители и методы растворения, чтобы не получить нерастворимые пептиды.
При синтезе длинных пептидов данные говорят сами за себя, и каждый шаг отслеживается.
5. От миллиграммов до ста миллиграммов, вплоть до конца
Миллиграммы на этапе скрининга, десять миллиграммов на этапе проверки, сто миллиграммов на структурном исследовании - мы можем взять все это. Тот же проект, тот же аналог, нет необходимости в повторной-гармонизации.
Для чего можно использовать длинные пептиды?
|
Области исследований |
Общее использование |
Мы сталкивались с ситуациями, когда |
|
мембранные белки |
трансмембранные фрагменты, внеклеточные петли |
Длинный пептид с множеством трансмембранных участков, высокогидрофобный. |
|
вирусные белки |
Слитые пептиды, рецептор-связывающие домены |
Новый фрагмент белка S коронавируса, около 100 аминокислот |
|
Амилоид |
А, -синуклеин |
42аа это норма. Более длинные были сделаны |
|
Антимикробные пептиды |
Длинноцепочечные противомикробные пептиды- |
Некоторые природные антимикробные пептиды содержат всего 40-60 аминокислот. |
|
Цитокины |
имитация активной зоны |
50-80а.к., с дисульфидными связями |
|
структурная биология |
ЯМР, кристаллография |
Isotopically labeled peptide, purity >98%. |
Доставка и контроль качества
- Доставка: Лиофилизированный порошок, в центрифужных пробирках или флаконах, защищенных азотом.
- Сопроводительные документы: сертификат подлинности (профиль ВЭЖХ + профиль МС), МС/МС (подтверждение последовательности необязательно), отчет о синтезе (процесс сегментации и сплайсинга).
- Дополнительные тесты: содержание пептидов, эндотоксинов, влажность, аминокислотный состав, тест на растворимость.
- Индивидуальная упаковка: порционирование и маркировка в соответствии с вашими требованиями.
- Перед отправкой каждый продукт Long Peptide Synthesis -проверяется дважды, чтобы убедиться в правильности последовательности и соответствии стандарту чистоты.



Три реальных-случая из жизни
Случай 1: Программа мембранных белков в научно-исследовательском институте
The customer needs a 85aa transmembrane peptide for structural study. This peptide has 60% of hydrophobic amino acids, so many companies could not make it. We used segmental synthesis, cut into three segments, each segment is about 30aa, purified and then liquid-phase ligated. The final purity of the peptide is >95%, и заказчик понял и сделал ЯМР.
Случай 2: Программа вирусных белков транснациональной фармацевтической компании
A 110aa viral fusion peptide with two pairs of disulfide bonds was required for inhibitor screening. We designed a segmented synthesis strategy to synthesize three linear fragments first, which were joined and then oxidized to form disulfide bonds. The final product was delivered with >Чистота 90%, правильно спаренные дисульфидные связи, пройдена проверка активности.
Случай 3: Исследование амилоида в национальном университете
The customer needs a 70aa fragment of alpha-synuclein for the study of aggregation mechanism. This peptide is easy to form fibers and always blocked the column during purification. We optimized the mobile phase conditions, added a small amount of organic solvent, and finally obtained a product with purity >95%, и заказчик успешно провел эксперименты ThT.
Говоря о ваших потребностях в длинных пептидах?
Если вам нужен трансмембранный пептид из 80 аминокислот или вирусный белок из 150 аминокислот, вы можете обратиться к нам. Если вы попросите Science-Peptide провести синтез длинных пептидов, по крайней мере, вам не придется пробовать один за другим.
Мне нужно, чтобы ты сказал мне:
Пептидная последовательность (или целевая информация)
Сколько (миллиграммы)
требования к чистоте
не имеют дисульфидных связей или других модификаций
Когда ты этого хочешь?
Дайте вам технико-экономическое обоснование и предложение в течение 24 часов.